Rによるデータ分析

Rによる多項ロジスティック回帰分析

多項ロジスティック回帰分析・順序ロジスティック回帰分析 のRによる実施例です。

多項ロジスティック回帰分析

多項ロジスティック回帰分析 です。 カテゴリが3つ以上ある場合です。

結果のグラフを作る部分以外は、2値の時と同じ手順でできます。

ここでは、以下のデータを使っています。
logistic

setwd("C:/Rtest")
Data <- read.csv("Data.csv", header=T)
library(ggplot2)
ggplot(Data, aes(x=X01, y=Y)) + geom_point()

logistic

library(nnet)
LR<-multinom(Y ~ X01, data=Data)
Data2 <- cbind(Data,LR$fitted.values)
Data2$Y <- NULL
library(tidyr)
Data_long <- tidyr::gather(Data2, key="Y_name", value = probability, -X01)
ggplot(Data_long, aes(x=X01,y=probability, colour=Y_name)) + geom_line() + geom_point()

logistic

順序ロジスティック回帰分析

順序ロジスティック回帰分析 です。 カテゴリが3つ以上あって、カテゴリの順番に意味がある場合です。

ここでは、以下のデータを使っています。
logistic

setwd("C:/Rtest")
Data <- read.csv("Data.csv", header=T)
library(ggplot2)
ggplot(Data, aes(x=X01, y=Y)) + geom_point()

logistic

library(MASS)
Data$Y <- as.factor(Data$Y)
LR<-polr(Y ~ X01, data=Data)
library(tidyr)
Data_long <- tidyr::gather(Data2, key="Y_name", value = probability, -X01)
ggplot(Data_long, aes(x=X01,y=probability, colour=Y_name)) + geom_line() + geom_point()

logistic



Rによるロジスティック回帰分析

Rによるベクトル量子化ロジスティック回帰分析

Rによる一般化線形混合モデル

参考文献

CRAN
https://cran.r-project.org/web/packages/MASS/MASS.pdf
MASSのマニュアルです。


CRAN
https://cran.r-project.org/web/packages/nnet/nnet.pdf
nnetのマニュアルです。



Rによるデータ分析

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